Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PompQ9CQT5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PompQ9CQT5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms