Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms