Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms