Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms