Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms