Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nus1Q99LJ8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms