Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp16Q99LG0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms