Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nmd3Q99L48 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms