Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms