Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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