Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms