Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Med28Q920D3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms