Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rhbdd2Q8VEK2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rhbdd2Q8VEK2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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