Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc115Q8VE99 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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