Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms