Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms