Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms