Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms