Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms