Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh13Q8CEE7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms