Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21aQ8C0S4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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