Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccser1Q8C0C4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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