Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsfm13Q8BXS2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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