Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ctdsp2Q8BX07 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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