Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx17Q8BVL3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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