Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc30Q8BVF4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc30Q8BVF4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc30Q8BVF4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc30Q8BVF4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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