Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tspan12Q8BKT6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan12Q8BKT6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms