Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp1Q8BJQ2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp1Q8BJQ2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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