Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms