Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg4bQ8BGE6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms