Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms