Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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