Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms