Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zbed4Q80WQ9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zbed4Q80WQ9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zbed4Q80WQ9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zbed4Q80WQ9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Zbed4Q80WQ9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zbed4Q80WQ9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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