Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atf7ipQ7TT18 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms