Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo2Q7TSY8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms