Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Dsg1bQ7TSF1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms