Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vstm2lQ6PDS0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms