Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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