Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fbxo27Q6DIA9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fbxo27Q6DIA9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms