Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Pkp4Q68FH0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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