Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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