Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PtprjQ64455 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprjQ64455 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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