Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Trim24Q64127 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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