Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Polr2kQ63871 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Polr2kQ63871 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms