Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nell2Q61220 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nell2Q61220 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms