Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cnot7Q60809 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cnot7Q60809 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnot7Q60809 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms