Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnk2a1Q60737 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnk2a1Q60737 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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