Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms