Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms